tg-me.com/data_analysis_ml/3732
Last Update:
🧬AlphaGenome от DeepMind — AI для глубокого понимания генома
🔬 Что это?
Новая унифицированная модель , способная предсказывать, как одиночные мутации в ДНК влияют на регуляцию генов и различные биомолекулярные процессы .
Как работает:
1. Принимает на вход до 1 000 000 «букв» ДНК (base-pairs) и выдаёт тысячи предсказаний по разным свойствам:
- Начало и конец генов в разных клетках
- Уровень сплайсинга и экспрессии РНК
- Доступность нуклеотидов и связывание с белками
2. Архитектура:
- Свёрточные слои для поиска локальных паттернов
- Трансформеры для обмена информацией по всей последовательности
- Финальные слои для предсказаний по каждому «букве»
Самое интересное:
- **Длинный контекст *: анализ до 1 000 000 букв с точностью до одной позиции
- Мультизадачность: единственная модель одновременно прогнозирует десятки регуляторных свойств (модальностей), от сплайсинга до хроматиновой доступности .
- Быстрое оценивание вариантов: сравнивает «дикую» и мутантную последовательности и за секунду выдаёт полный отчёт по влиянию мутации .
- Новые возможности в сплайсинге: впервые модель прямо предсказывает расположение и уровень сплайс-джанкшенов, что важно для редких генетических заболеваний .
- Превосходство на бенчмарках: лидер по точности на 22 из 24 задач по предсказанию свойств и на 24 из 26 задач по эффектам вариаций .
Для чего это нужно:
• Ускорить исследование генетических причин болезней и найти новые терапевтические мишени
• Помочь в дизайне синтетической ДНК для заданных функций
• Глубже понять функции некодирующих участков генома
Доступ:
— Preview-версия API для некоммерческих исследований: https://github.com/deepmind/alphagenome-api
— Полная модель будет опубликована позже.
BY Анализ данных (Data analysis)
Share with your friend now:
tg-me.com/data_analysis_ml/3732