tg-me.com/biopycourse/6
Last Update:
📃 سرفصل های دوره :
آموزش بیوانفورماتیک با استفاده از زبان پایتون
1. معرفی پایتون و کاربردهای آن در بیوانفورماتیک
- مروری بر پایتون و اهمیت آن در بیوانفورماتیک.
- مثالهایی از کاربردهای بیوانفورماتیک: تحلیل توالیها، تجسم دادهها، و یادگیری ماشین در ژنومیک.
2. نصب پایتون و راهاندازی محیطهای توسعه
- نصب پایتون و تنظیم محیطهای توسعه (IDLE، VS Code، Jupyter Notebook).
- معرفی Jupyter Notebook برای گردش کارهای بیوانفورماتیک.
3. عملگرها و عبارات در پایتون
- عملگرهای ریاضی، مقایسهای، منطقی و انتسابی.
- مثالهای عملی: محاسبهی محتوای GC در توالیهای DNA.
4. عملیات روی رشتهها و فرمتبندی متن
- کار با رشتهها: برش، الحاق، و فرمتدهی.
- کاربردها: تجزیهی فایلهای FASTA و استخراج اطلاعات توالی.
5. کنترل جریان برنامه (دستورات شرطی)
- دستورات شرطی: if
، elif
، else
.
- شرایط منطقی و شرطهای تو در تو (Nesting).
- کاربردها: فیلتر کردن توالیها بر اساس معیارهای خاص.
6. حلقهها (for و while)
- حلقههای for
و while
.
- کنترل جریان حلقهها: break
، continue
، pass
.
- کاربردها: پیمایش توالیها و تحلیل چندین توالی.
7. پیمایش در رشتهها، لیستها و محدودهها (range)
- پیمایش در رشتهها، لیستها و محدودهها.
- کاربردها: پردازش چندین توالی یا مجموعهداده.
8. توابع و ماژولها
- تعریف و فراخوانی توابع.
- پارامترها و مقدار بازگشتی (Return Values).
- کاربردها: ایجاد توابع قابل استفاده مجدد برای تحلیل توالیها.
9. ساختمان دادهها
- لیستها، تاپلها، مجموعهها و دیکشنریها.
- کاربردها: ذخیرهسازی و مدیریت دادههای زیستی (مانند توالیها و حاشیهنویسیها).
10. کار با فایلها و مدیریت استثناها (Exception Handling)
- خواندن و نوشتن فایلها: open()
، read()
، write()
.
- مدیریت استثناها: کنترل خطاها در عملیات فایلی.
- کاربردها: خواندن/نوشتن فایلهای FASTA، FASTQ یا CSV.
11. مبانی برنامهنویسی شیگرا (OOP)
- معرفی کلاسها و اشیا.
- ویژگیها و متدها.
- کاربردها: مدلسازی موجودیتهای زیستی (مانند ژنها و پروتئینها).
12. کار با کتابخانهها و APIها
- معرفی کتابخانههای خارجی: Biopython
، requests
، json
، os
.
- کار با APIها: دریافت داده از پایگاههای دادهی زیستی (مانند NCBI، UniProt).
13. پروژه عملی و جمعبندی نهایی
- پروژه کوچک: ساخت یک ابزار سادهی بیوانفورماتیک (مانند تحلیلگر توالی یا طراحی پرایمر).
- تکنیکهای دیباگینگ و بهترین روشهای برنامهنویسی.
14. مسیرهای شغلی و گامهای بعدی در یادگیری پایتون برای بیوانفورماتیک
- بررسی فرصتهای شغلی در بیوانفورماتیک.
- منابع برای یادگیری بیشتر: پایتون پیشرفته، یادگیری ماشین، و علم داده.
BY BioPy
Warning: Undefined variable $i in /var/www/tg-me/post.php on line 283
Share with your friend now:
tg-me.com/biopycourse/6