Telegram Group & Telegram Channel
📃 سرفصل های دوره :
آموزش بیوانفورماتیک با استفاده از زبان پایتون

1. معرفی پایتون و کاربردهای آن در بیوانفورماتیک
   - مروری بر پایتون و اهمیت آن در بیوانفورماتیک. 
   - مثال‌هایی از کاربردهای بیوانفورماتیک: تحلیل توالی‌ها، تجسم داده‌ها، و یادگیری ماشین در ژنومیک. 

2. نصب پایتون و راه‌اندازی محیط‌های توسعه
   - نصب پایتون و تنظیم محیط‌های توسعه (IDLE، VS Code، Jupyter Notebook). 
   - معرفی Jupyter Notebook برای گردش کارهای بیوانفورماتیک. 

3. عملگرها و عبارات در پایتون
   - عملگرهای ریاضی، مقایسه‌ای، منطقی و انتسابی. 
   - مثال‌های عملی: محاسبه‌ی محتوای GC در توالی‌های DNA. 

4. عملیات روی رشته‌ها و فرمت‌بندی متن
   - کار با رشته‌ها: برش، الحاق، و فرمت‌دهی. 
   - کاربردها: تجزیه‌ی فایل‌های FASTA و استخراج اطلاعات توالی. 

5. کنترل جریان برنامه (دستورات شرطی) 
   - دستورات شرطی: if، elif، else
   - شرایط منطقی و شرط‌های تو در تو (Nesting). 
   - کاربردها: فیلتر کردن توالی‌ها بر اساس معیارهای خاص. 

6. حلقه‌ها (for و while)
   - حلقه‌های for و while
   - کنترل جریان حلقه‌ها: break، continue، pass
   - کاربردها: پیمایش توالی‌ها و تحلیل چندین توالی. 

7. پیمایش در رشته‌ها، لیست‌ها و محدوده‌ها (range)
   - پیمایش در رشته‌ها، لیست‌ها و محدوده‌ها. 
   - کاربردها: پردازش چندین توالی یا مجموعه‌داده. 

8. توابع و ماژول‌ها 
   - تعریف و فراخوانی توابع. 
   - پارامترها و مقدار بازگشتی (Return Values). 
   - کاربردها: ایجاد توابع قابل استفاده مجدد برای تحلیل توالی‌ها. 

9. ساختمان داده‌ها
   - لیست‌ها، تاپل‌ها، مجموعه‌ها و دیکشنری‌ها. 
   - کاربردها: ذخیره‌سازی و مدیریت داده‌های زیستی (مانند توالی‌ها و حاشیه‌نویسی‌ها). 

10. کار با فایل‌ها و مدیریت استثناها (Exception Handling)
    - خواندن و نوشتن فایل‌ها: open()، read()، write()
    - مدیریت استثناها: کنترل خطاها در عملیات فایلی. 
    - کاربردها: خواندن/نوشتن فایل‌های FASTA، FASTQ یا CSV. 

11. مبانی برنامه‌نویسی شی‌گرا (OOP) 
    - معرفی کلاس‌ها و اشیا. 
    - ویژگی‌ها و متدها. 
    - کاربردها: مدل‌سازی موجودیت‌های زیستی (مانند ژن‌ها و پروتئین‌ها). 

12. کار با کتابخانه‌ها و APIها
    - معرفی کتابخانه‌های خارجی: Biopython، requests، json، os
    - کار با APIها: دریافت داده از پایگاه‌های داده‌ی زیستی (مانند NCBI، UniProt). 

13. پروژه عملی و جمع‌بندی نهایی 
    - پروژه کوچک: ساخت یک ابزار ساده‌ی بیوانفورماتیک (مانند تحلیل‌گر توالی یا طراحی پرایمر). 
    - تکنیک‌های دیباگینگ و بهترین روش‌های برنامه‌نویسی. 

14. مسیرهای شغلی و گام‌های بعدی در یادگیری پایتون برای بیوانفورماتیک
    - بررسی فرصت‌های شغلی در بیوانفورماتیک. 
    - منابع برای یادگیری بیشتر: پایتون پیشرفته، یادگیری ماشین، و علم داده.



tg-me.com/biopycourse/6
Create:
Last Update:

📃 سرفصل های دوره :
آموزش بیوانفورماتیک با استفاده از زبان پایتون

1. معرفی پایتون و کاربردهای آن در بیوانفورماتیک
   - مروری بر پایتون و اهمیت آن در بیوانفورماتیک. 
   - مثال‌هایی از کاربردهای بیوانفورماتیک: تحلیل توالی‌ها، تجسم داده‌ها، و یادگیری ماشین در ژنومیک. 

2. نصب پایتون و راه‌اندازی محیط‌های توسعه
   - نصب پایتون و تنظیم محیط‌های توسعه (IDLE، VS Code، Jupyter Notebook). 
   - معرفی Jupyter Notebook برای گردش کارهای بیوانفورماتیک. 

3. عملگرها و عبارات در پایتون
   - عملگرهای ریاضی، مقایسه‌ای، منطقی و انتسابی. 
   - مثال‌های عملی: محاسبه‌ی محتوای GC در توالی‌های DNA. 

4. عملیات روی رشته‌ها و فرمت‌بندی متن
   - کار با رشته‌ها: برش، الحاق، و فرمت‌دهی. 
   - کاربردها: تجزیه‌ی فایل‌های FASTA و استخراج اطلاعات توالی. 

5. کنترل جریان برنامه (دستورات شرطی) 
   - دستورات شرطی: if، elif، else
   - شرایط منطقی و شرط‌های تو در تو (Nesting). 
   - کاربردها: فیلتر کردن توالی‌ها بر اساس معیارهای خاص. 

6. حلقه‌ها (for و while)
   - حلقه‌های for و while
   - کنترل جریان حلقه‌ها: break، continue، pass
   - کاربردها: پیمایش توالی‌ها و تحلیل چندین توالی. 

7. پیمایش در رشته‌ها، لیست‌ها و محدوده‌ها (range)
   - پیمایش در رشته‌ها، لیست‌ها و محدوده‌ها. 
   - کاربردها: پردازش چندین توالی یا مجموعه‌داده. 

8. توابع و ماژول‌ها 
   - تعریف و فراخوانی توابع. 
   - پارامترها و مقدار بازگشتی (Return Values). 
   - کاربردها: ایجاد توابع قابل استفاده مجدد برای تحلیل توالی‌ها. 

9. ساختمان داده‌ها
   - لیست‌ها، تاپل‌ها، مجموعه‌ها و دیکشنری‌ها. 
   - کاربردها: ذخیره‌سازی و مدیریت داده‌های زیستی (مانند توالی‌ها و حاشیه‌نویسی‌ها). 

10. کار با فایل‌ها و مدیریت استثناها (Exception Handling)
    - خواندن و نوشتن فایل‌ها: open()، read()، write()
    - مدیریت استثناها: کنترل خطاها در عملیات فایلی. 
    - کاربردها: خواندن/نوشتن فایل‌های FASTA، FASTQ یا CSV. 

11. مبانی برنامه‌نویسی شی‌گرا (OOP) 
    - معرفی کلاس‌ها و اشیا. 
    - ویژگی‌ها و متدها. 
    - کاربردها: مدل‌سازی موجودیت‌های زیستی (مانند ژن‌ها و پروتئین‌ها). 

12. کار با کتابخانه‌ها و APIها
    - معرفی کتابخانه‌های خارجی: Biopython، requests، json، os
    - کار با APIها: دریافت داده از پایگاه‌های داده‌ی زیستی (مانند NCBI، UniProt). 

13. پروژه عملی و جمع‌بندی نهایی 
    - پروژه کوچک: ساخت یک ابزار ساده‌ی بیوانفورماتیک (مانند تحلیل‌گر توالی یا طراحی پرایمر). 
    - تکنیک‌های دیباگینگ و بهترین روش‌های برنامه‌نویسی. 

14. مسیرهای شغلی و گام‌های بعدی در یادگیری پایتون برای بیوانفورماتیک
    - بررسی فرصت‌های شغلی در بیوانفورماتیک. 
    - منابع برای یادگیری بیشتر: پایتون پیشرفته، یادگیری ماشین، و علم داده.

BY BioPy


Warning: Undefined variable $i in /var/www/tg-me/post.php on line 283

Share with your friend now:
tg-me.com/biopycourse/6

View MORE
Open in Telegram


BioPy Telegram | DID YOU KNOW?

Date: |

Telegram has exploded as a hub for cybercriminals looking to buy, sell and share stolen data and hacking tools, new research shows, as the messaging app emerges as an alternative to the dark web.An investigation by cyber intelligence group Cyberint, together with the Financial Times, found a ballooning network of hackers sharing data leaks on the popular messaging platform, sometimes in channels with tens of thousands of subscribers, lured by its ease of use and light-touch moderation.

The SSE was the first modern stock exchange to open in China, with trading commencing in 1990. It has now grown to become the largest stock exchange in Asia and the third-largest in the world by market capitalization, which stood at RMB 50.6 trillion (US$7.8 trillion) as of September 2021. Stocks (both A-shares and B-shares), bonds, funds, and derivatives are traded on the exchange. The SEE has two trading boards, the Main Board and the Science and Technology Innovation Board, the latter more commonly known as the STAR Market. The Main Board mainly hosts large, well-established Chinese companies and lists both A-shares and B-shares.

BioPy from br


Telegram BioPy
FROM USA